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2001年6月6日，經重慶市民政局批準，由中國人民銀行重慶營業管理部主管，14家在渝銀行業金融機構正式發起成立重慶銀行業協會，履行自律、維權、協調、服務等職能。
2004年主管單位由人行改為原重慶銀監局，現為重慶銀保監局。2009年7月27日根據原中國銀監會有關文件精神，重慶銀行業協會更名為重慶市銀行業協會。
經過21年的發展，協會緊跟國家改革發展步伐，協會從最初的14個會員發展到111個。協會會員大會作為最高權力機構，均按照章程的規定和要求按時召開會員大會、進行換屆選舉等工作，切實履行章程規定的職能。協會理事會、監事會、秘書處等組織健全。理事會現有理事19名，監事會由監事長和2名監事共3人組成，經民主選舉產生。協會會長1名、專職副會長1名、副會長2名在理事中選舉產生。
協會下設秘書處，為常設辦事機構。現有專職工作人員30人，秘書處內設辦公室、自律部、維權部、教育培訓部等部門，另發起成立重慶銀行業人民調解委員會(銀行業消費者投訴糾紛調解中心)。協會根據行業性質和實際工作需要，現設有法律合規、零售業務、文明規范服務、利率自律、人力資源、信息科技、安全保衛、銀團貸款、消費者權益保護、綠色金融、宣傳工作等11個專業委員會以及外資銀行、新型農村金融機構、非銀行金融機構、清廉金融文化建設等4個工作委員會。在制定行業有關業務規范、公約及實施細則、業務制度、信息溝通、業務協調、調查研究、培訓教育、會員權益維護等方面發揮作用。被重慶市民政局于2013年、2018年兩次評為AAAAA社會組織。